На кадрах видно, что чистая и мутная вода не смешиваются между собой и чётко разделены. 

Разница плотности: горные паводковые или мутные воды содержат много песка, ила и глины, поэтому их плотность значительно выше, чем у воды озера.

Разница температуры: вода, приходящая с ледников, очень холодная, тогда как вода у берега Иссык-Куля летом тёплая. Воды с разной температурой не смешиваются сразу.

Химический состав (солёность): вода озера Иссык-Куль слегка солоноватая, тогда как горная вода пресная. Это также создаёт временный «невидимый барьер» между ними.

Интересный факт: подобное явление наблюдается в мире, например, в месте слияния Атлантического и Тихого океанов, а также в Бразилии — на месте соединения рек Риу-Негру и Амазонки (это явление называют «свадьбой вод»). В Иссык-Куле это явление носит временный характер — под воздействием волн и ветра воды постепенно всё равно смешиваются.