В настоящее время Санжар Сапарбеков продолжает отбывать назначенное судом наказание в учреждении №1 Государственной службы исполнения наказаний.

Санжар Сапарбеков был осужден по делу об убийстве бывшего руководителя администрации президента Медета Садыркулова, бывшего директора Международного института стратегических исследований Сергея Слепченко и водителя Кубанычбека Сулайманова в 2009 году.

В ноябре 2022 года Аламединский районный суд признал Сапарбекова виновным и приговорил его к 14 годам лишения свободы в колонии общего режима. Тогда суд признал его виновным в убийстве, незаконном лишении свободы, уничтожении документов и чужого имущества.

Ему предъявляли обвинения по нескольким статьям УК КР, включая убийство, похищение человека, разбой, угон автомототранспортного средства, уничтожение или повреждение чужого имущества, создание преступного сообщества или участие в нем и вандализм.

Медет Садыркулов, Сергей Слепченко и Кубанычбек Сулайманов были убиты в марте 2009 года. Первоначально их гибель представляли как ДТП, однако позже следствие пришло к версии об убийстве с последующей инсценировкой автокатастрофы. По версии следствия, Сапарбеков участвовал в похищении, удержании и убийстве Садыркулова и Слепченко, а также в уничтожении следов преступления.

Санжар Сапарбеков также проходил по делу об убийстве кримавторитета Чынгыза Джумагулова по прозвищу Доо Чынгыз. Он был среди подозреваемых/обвиняемых по этому делу. Джумагулов был убит 30 июля 2022 года в СИЗО-1 Бишкека.

В апреле 2024 года Октябрьский районный суд Бишкека вынес приговор по делу об убийстве Доо Чынгыза. Санжара Сапарбекова приговорили к 17 годам и 3 месяцам лишения свободы и штрафу в 15 тыс. сомов.