Поводом для разбирательства стал иск бывшего соперника Бакирова на выборах — Равшанбека Рысбаева. В конце 2022 года тот обвинил депутата в подкупе голосов и потребовал отменить результаты выборов.

Сам Бакиров ранее связывал уголовное преследование со своей позицией по Кемпир-Абадскому водохранилищу, которое власти Кыргызстана хотели передать Узбекистану. В ноябре 2022 года во время обсуждения соглашения о делимитации кыргызско-узбекской границы в парламенте у него произошла публичная перепалка с тогдашним главой ГКНБ Камчыбеком Ташиевым.

Конфликт начался после того, как Бакиров заявил, что вода необходима кыргызской стороне, и спросил у Ташиева:

«Вы задавали узбекской стороне вопрос, почему они не строят левобережный канал для Кемпир-Абада?»

В ответ Ташиев с трибуны оскорбил депутата Омурбека Бакирова нецензурной бранью.

Омурбек Бакиров был избран депутатом от №4 Кок-Жарского избирательного округа Ноокатского района Ошской области.

В шестом созыве Жогорку Кенеша Бакиров стал лидером фракции СДПК вместо Иса Омуркулов. На выборах 2020 года, результаты которых впоследствии были отменены, он состоял в провластной партии «Биримдик».

По данным Радио Азаттык, Бакиров состоял на учёте МВД как член организованной преступной группы. Также сообщалось, что он был «крёстным сыном» криминального авторитета Алмамбета Анапияева, который был убит в 2015 году в Минске.

В 2004 году против Бакирова и Анапияева возбуждались уголовные дела по статьям «Похищение человека», «Разбой», «Незаконное лишение свободы» и «Вымогательство». Позднее суд их оправдал.

Кроме того, в 2010 году Бакирова обвиняли в «попытке насильственного свержения» Временного правительства. Сам Бакиров эти обвинения отвергает.